Tek maç eleminasyon usulüne göre 21-22 Aralık tarihlerinde oynanacak 2. tur maçlarında, ilk kademede rakibine üstünlük sağlayan Gaziosmanpaşa, Eyüpspor, Ünyespor, BUGSAŞ Spor, Çorumspor, Bandırmaspor, Göztepe, Fethiyespor, Şanlıurfaspor, Konya Torku Şekerspor ve Adana Demirspor ile birlikte, 2010-2011 sezonu sonunda Spor Toto Süper Lig'den düşen 3 takım ve aynı sezon Bank Asya 1. Lig'de oynayan, Spor Toto Süper Lig'e yükselemeyen 14 takımın oluşturacağı 28 takım mücadele edecek.
Bu turda, 1. eleme turundan gelen 11 takım, Spor Toto Süper Lig'den düşen 3 takım ve geçen sezon Spor Toto Süper Lig'e yükselemeyen takım sıralamasında ilk 8 sırada yer alan Bank Asya 1. Lig takımları birbiriyle eşleşti. Geçen sezon Bank Asya 1. Lig'de sıralamada geriye kalan 6 takım da kura usulü birbiriyle eşleşti.
50. yılda yeni statü
Türkiye Futbol Federasyonu tarafından yenilenen Türkiye Kupası statüsünde grup maçları kaldırıldı. Bu sezon eleme usulüne göre yapılacak kupada, tüm profesyonel liglerden 57 takım mücadele edecek. İlk 4 eleme turunun ardından final aşamasına geçilecek kupada, çeyrek final maçları, dördüncü eleme turunda tur atlayan 8 takım arasında, TFF tarafından belirlenecek tarafsız sahada tek maçlı eleme usulüne göre oynanacak.
Kupada yarı final müsabakaları da çeyrek finalde tur atlayan 4 kulüp arasında TFF'nin belirleyeceği tarafsız sahada tek maçlı eleme usulüne göre yapılacak. Eşleşmeler, çeyrek final müsabakaları kura çekimi sırasında belirlenecek. 50. Türkiye Kupası finali ise yarı finalde tur atlayan iki takım arasında tarafsız sahada tek maç üzerinden oynanacak.
Kura çekimi sonrasında eşleşmeler şu şekilde oluştu:
TKİ Tavşanlıspor - BUGSAŞ Spor
Eyüpspor - Bucaspor
Çaykur Rizespor - Çorumspor
Gaziosmanpaşa - Giresunspor
Karşıyaka - Ünyespor
Şanlıurfaspor - Denizlispor
Gaziantep Büyükşehir Belediyespor - Göztepe
Konya Torku Şekerspor - Konyaspor
Kasımpaşa - Bandırmaspor
Adana Demirspor - Kayseri Erciyesspor
Boluspor - Fethiyespor
Adanaspor - Kartalspor
Diyarbakırspor - İstanbul Güngörenspor
Akhisar Belediyespor - Altay